Επεισόδιο 1: “A Tale of Two Cities”
Ο Jack βρίσκεται φυλακισμένος στη Hydra, έναν υποθαλάσσιο σταθμό της Dharma Initiative, και ανακρίνεται από ένα μέλος των Others, την Juliet. Η Kate και ο Sawyer κρατούνται σε κλουβιά κάπου κοντά. Ο Sawyer προσπαθεί να αποδράσει μαζί με έναν έφηβο Other που ονομάζεται Karl, αλλά δεν τα καταφέρνει. Αποκαλύπτεται ότι ο “Henry Gale”, το πραγματικό όνομα του οποίου είναι Ben, είναι όντως ο αρχηγός των Others. Σε μια σειρά από flashbacks, ο Jack προσπαθεί μανιασμένα να μάθει με ποιον έχει σχέση η γυναίκα του Sarah κατά την διάρκεια των διαπραγματεύσεων για το διαζύγιο. Ο Jack υποπτεύεται τον πατέρα του και του επιτίθεται σε μια συνάντηση των Ανώνυμων Αλκοολικών. Ο Jack συλλαμβάνεται και η Sarah πληρώνει την εγγύηση για την αποφυλάκισή του.
Επεισόδιο 2: “The Glass Ballerina”
Ο Ben προσφέρεται να οδηγήσει τον Jack μακριά από το νησί αν εκείνος συνεργαστεί. Η Kate και ο Sawyer οδηγούνται έξω από τα κλουβιά τους για να σπάσουν πέτρες και αποκαλύπτεται ότι ο Ben τους παρακολουθεί με κάμερες. Επάνω στο ιστιοφόρο, η Sun, ο Jin και ο Sayid πέφτουν θύματα ενέδρας από τους Others. Η Sun πυροβολεί το μέλος των Others, Colleen, και το σκάφος καταλαμβάνεται από τους Others. Η Sun, ο Jin και ο Sayid επιστρέφουν στον καταυλισμό. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τον πατέρα της Sun να ανακαλύπτει τον δεσμό της με τον Jae Lee. Διατάζει τον Jin να σκοτώσει τον Jae Lee, αλλά ο Jin απλά τον απειλεί και στην συνέχεια ο Jae αυτοκτονεί.
Επεισόδιο 3: “Further Instructions”
Ο Locke, ο Desmond και ο Eko επιζούν από την έκρηξη στην καταπακτή. Ο Locke βλέπει ένα όραμα με τον Boone και πηγαίνει με τον Charlie για να σώσει τον Eko από την πολική αρκούδα. Ο Hurley ανακαλύπτει ότι ο Desmond μπορεί να βλέπει το μέλλον. Σε μια σειρά από flashbacks, ο Locke φέρνει κατά λάθος έναν αστυνομικό στην κοινότητα της φυτείας μαριχουάνας, της οποίας είναι μέλος.
Επεισόδιο 4: “Every Man for Himself”
Η Colleen πεθαίνει και ο σύζυγός της, Pickett, ξεσπά τον θυμό του χτυπώντας τον Sawyer. Οι Others κάνουν τον Sawyer να πιστέψει ότι του έχουν εμφυτέψει έναν βηματοδότη και ότι η καρδιά του θα εκραγεί αν ο ρυθμός της ξεπεράσει τους 140 παλμούς το λεπτό. Ο Ben αποκαλύπτει στον Sawyer ότι κάθε προσπάθεια διαφυγής είναι μάταιη διότι βρίσκονται σε ένα άλλο νησί, στα ανοιχτά του νησιού που βρίσκεται ο καταυλισμός των επιζώντων. Σε μια σειρά από flashbacks, ο Sawyer βγαίνει από την φυλακή με μια σειρά από απάτες και ανακαλύπτει ότι έχει μια κόρη. Αφού ισχυρίζεται ότι δεν νοιάζεται για εκείνη, της χαρίζει ανώνυμα ένα μεγάλο χρηματικό ποσό.
Επεισόδιο 5: “The Cost of Living”
Ο Eko ακολουθεί κάποιον που μοιάζει με τον αδερφό του μέσα στη ζούγκλα. Τελικά πρόκειται για το τέρας από καπνό, το οποίο σκοτώνει τον Eko. Ο Jack ανακαλύπτει πως ο λόγος για τον οποίο τον συνέλαβαν είναι για να αφαιρέσει χειρουργικά τον όγκο που έχει ο Ben στην σπονδυλική του στήλη. Η Juliet συνωμοτεί με τον Jack κατά του Ben, ζητώντας του να σκοτώσει τον Ben κατά την διάρκεια της εγχείρησης, κάνοντάς το να φανεί ως ατύχημα. Σε μια σειρά από flashbacks, ο Eko γίνεται ιερέας ότι ο Yemi σκοτώνεται και εκείνος με τη σειρά του σκοτώνει μια ομάδα αντρών για να προστατέψει το χωριό του.
Επεισόδιο 6: “I Do”
Η Kate και ο Sawyer αποκαλύπτουν τα αισθήματα που τρέφει ο ένας για τον άλλο κάνοντας έρωτα. Ο Pickett σχεδόν σκοτώνει τον Sawyer όταν ο Jack διακόπτει την εγχείρηση του Ben και απειλεί να τον σκοτώσει αν οι Others δεν απελευθερώσουν τον Sawyer και την Kate. Σε μια σειρά από flashbacks, η Kate προσπαθεί να ζήσει μια φυσιολογική ζωή και παντρεύεται, αλλά καταλήγει να τρέξει μακριά όταν αποκαλύπτει στον σύζυγό της ποια είναι.
Επεισόδιο 7: “Not in Portland”
Η έφηβη Alex, μέλος των Others, εφοδιάζει την Kate και τον Sawyer με ένα κανό για να επιστρέψουν στο νησί τους, αλλά πρώτα τους πείθει να την βοηθήσουν να σώσει το αγόρι της, τον Karl, από ένα δωμάτιο στο οποίο του κάνουν πλύση εγκεφάλου παρακολουθώντας ένα βίντεο. Η Juliet σκοτώνει τον Pickett, ο οποίος κατεδίωκε την Kate και τον Sawyer. Ο Jack ολοκληρώνει τη χειρουργική επέμβαση του Ben. Μια σειρά από flashbacks αποκαλύπτουν ότι για περισσότερα από τρία χρόνια πριν τη συντριβή του αεροπλάνου, η Juliet ήταν εξειδικευμένη γιατρός σε θέματα γονιμότητας, και ότι μπόρεσε να κάνει την αδερφή της ικανή να τεκνοποιήσει. Η Juliet περνά από συνέντευξη για μια θέση στην εταιρία Mittelos Bioscience.
Επεισόδιο 8: “Flashes Before your Eyes”
Ο Charlie και ο Hurley προσπαθούν να μεθύσουν τον Desmond για να τους εξηγήσει με ποιο τρόπο μπορεί να δει το μέλλον. Ένα εκτενές flashback αποκαλύπτει τι συνέβη στον Desmond μετά την έκρηξη της καταπακτής. Ο Desmond ξαναζεί μια μέρα της ζωής του με την Penny, πριν φτάσει στο νησί. Βρίσκεται ξανά στο νησί με την ικανότητα να βλέπει στιγμιότυπα από το μέλλον, με πιο αξιοσημείωτο τον θάνατο του Charlie.
Επεισόδιο 9: “Stranger in a Strange Land”
Η Juliet δικάζεται για τη δολοφονία του Pickett. Με τη βοήθεια του Jack και του Ben, η Juliet δεν καταδικάζεται με τη θανατική ποινή. Οι Others και ο Jack αρχίζουν το ταξίδι για τη βάση των Others, η οποία βρίσκεται σε ένα άλλο νησί. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τον Jack να αποκτά τα τατουάζ του κατά την διάρκεια ενός παράξενου ταξιδιού στην Ταϊλάνδη.
Επεισόδιο 10: “Tricia Tanaka is Dead”
Η Kate και ο Sawyer επιτρέφουν στην ακτή. Ο Hurley ανακαλύπτει ένα παλιό, εγκαταλειμμένο ημιφορτηγό στη ζούγκλα και το οδηγεί με τον Charlie, τον Sawyer και τον Jin. Η Kate, ο Sayid και ο Locke φεύγουν από τον καταυλισμό για να σώσουν τον Jack. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τον πατέρα του Hurley να επιστρέφει στο σπίτι, όταν ο Hurley κερδίζει τη λοτταρία.
Επεισόδιο 11: “Enter 77”
Ο Locke, ο Sayid και η Kate ερευνούν ένα σταθμό τηλεπικοινωνιών της Dharma μέσα στη ζούγκλα και συναντούν τον κάτοικό του, Mikhail. Καθώς φεύγουν από τον σταθμό, ο Locke τον ανατινάζει. Ο Sawyer ανταγωνίζεται τον Hurley στο πινγκ-πονγκ για να πάρει πίσω τα υπάρχοντά του, αλλά χάνει και αναγκάζεται να μην χρησιμοποιεί ψευδώνυμα για μία εβδομάδα. Σε μια σειρά από flashbacks, ο Sayid συναντά στο Παρίσι ένα από τα θύματα που είχε βασανίσει.
Επεισόδιο 12: “Par Avion”
Η Claire μαθαίνει για την προφητεία του Desmond. Αργότερα δένει ένα μήνυμα στο πόδι ενός πουλιού και το απελευθερώνει. Ο Locke, ο Sayid και η Kate πλησιάζουν ένα ηχητικό φράγμα που προστατεύει τη βάση των Others κατά την διάρκεια της αποστολής διάσωσης του Jack. Ο Locke σπρώχνει τον Mikhail, ένα μέλος των Others που έχουν συλλάβει ως όμηρο, πάνω στον φράγμα και εκείνος πεθαίνει. Ο Locke, ο Sayid και η Kate σκαρφαλώνουν πάνω από το φράγμα χωρίς πρόβλημα. Σε μια σειρά από flashbacks αποκαλύπτεται ότι η Claire έχει τον ίδιο πατέρα με τον Jack. Η Claire συναντά τον πατέρα της για πρώτη φορά όταν η μητέρα της γίνεται φυτό, ως αποτέλεσμα ενός αυτοκινητικού ατυχήματος στο οποίο ευθυνόταν η Claire.
Επεισόδιο 13: “The Man from Tallahassee”
Ο Locke, ο Sayid και η Kate βρίσκουν τα σπίτια των Others για πρώτη φορά και τον Jack σχετικά ευχαριστημένο. Ο Jack και η Juliet, η σχέση των οποίων έχει εξελιχθεί, έχουν συμφωνήσει με τον Ben να φύγουν από το νησί με το υποβρύχιο των Others, όμως ο Locke το ανατινάζει. Ο Ben αποκαλύπτει ότι κρατά αιχμάλωτο τον πατέρα του Locke. Σε μια σειρά από flashbacks, ο πατέρας του Locke τον πετά από ένα παράθυρο και ο Locke μένει παράλυτος.
Επεισόδιο 14: “Expose”
Ο Charlie λέει στη Sun ότι εκείνος και ο Sawyer ήταν υπεύθυνοι για την προσπάθεια απαγωγής της στη ζούγκλα. Οι επιζώντες ερευνούν τον θάνατο της Nikki και του Paulo. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τη Nikki και τον Paulo να τσακώνονται για κάποια διαμάντια που έκλεψαν από ένα πλούσιο στέλεχος της τηλεόρασης. Στο νησί, η Nikki απελευθερώνει δηλητηριώσεις αράχνες πάνω στον Paulo, αλλά αυτές δαγκώνουν και τους δύο, παραλύοντάς τους για οκτώ ώρες. Οι επιζώντες δεν καταλαβαίνουν τι ήταν αυτό που παρέλυσε τη Nikki και τον Paulo και χωρίς να το γνωρίζουν τους θάβουν ζωντανούς.
Επεισόδιο 15: “Left Behind”
Οι Others και ο Locke αφήνουν πίσω τα σπίτια τους. Ο Hurley εξαπατά τον Sawyer και τον αναγκάζει να συμφιλιωθεί με τους υπόλοιπους επιζώντες. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τα βήματα που έκανε η Kate για να μπορέσει να συναντήσει ξανά τη μητέρα της, η οποία δεν την ήθελε κοντά της.
Επεισόδιο 16: “One of Us”
Ο Jack, ο Sayid, η Kate και η Juliet επιστρέφουν από τον καταυλισμό των Others και εξαιτίας της επιμονής του να εμπιστευτούν τη Juliet, οι υπόλοιποι επιζώντες αμφισβητούν τα κίνητρα του Jack. Μια μυστηριώδης αρρώστια χτυπά την Claire, η οποία ενεργοποιείται από ένα εμφύτευμα των Others στο σώμα της. Η Juliet την φροντίζει. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τη ζωή της Juliet στο νησί. Η Juliet κρατείται στο νησί παρά τη θέλησή της και αδυνατεί να σώσει από τον θάνατο τις γυναίκες που μένουν έγγυες στο νησί. Τα flashbacks δείχνουν επίσης τη Juliet να συνωμοτεί με τον Ben για να γίνει πληροφοριοδότρια των Others στον καταυλισμό των επιζώντων.
Επεισόδιο 17: “Catch-22”
Οδηγημένος από οράματα, ο Desmond παρασύρει τον Charlie, τον Hurley και τον Jin σε μια πεζοπορεία κατά μήκος της ζούγκλας όπου ανακαλύπτουν την Naomi, μία αλεξιπτωτίστρια. Η Kate στρέφεται στον Sawyer όταν βλέπει τον Jack μόνο του με τη Juliet. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν την περίοδο που ο Desmond ήταν μοναχός και τη συνάντησή του με την Penny.
Επεισόδιο 18: “D.O.C.”
Όταν μαθαίνει ότι οι έγγυες γυναίκες των Others πέθαιναν κατά τη γέννα στο νησί, η Sun επιτρέπει στην Juliet να την εξετάσει σε έναν ιατρικό σταθμό της Dharma. Η Juliet αναφέρεται στον Ben. Ο Desmond συναντά τον ζωντανό Mikhail στη ζούγκλα και του επιτρέπει να βοηθήσει στη διάσωση της Naomi. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τη Sun να εκβιάζεται από τη βιολογική μητέρα του Jin, την οποία η Sun θεωρούσε νεκρή.
Επεισόδιο 19: “The Brig”
Μια σειρά από flashbacks δείχνουν τον Locke καθώς ζει με τους Others, οι οποίοι κρατούν αιχμάλωτο τον πατέρα του. Στο παρών, ο Locke πείθει τον Sawyer να τον ακολουθήσει στο Black Rock, για να δει τον πατέρα του. Ο Sawyer σκοτώνει τον πατέρα του Locke, ο οποίος αποκαλύπτεται πως είναι ο αρχικός Sawyer.
Επεισόδιο 20: “The Man Behind the Curtain”
Ο Locke επιστρέφει στους Others και ο Ben ενοχλημένος τον πηγαίνει για να συναντήσει τον μυστηριώδη αρχηγό τους, τον Jacob. Ο Locke αδυνατεί να δει τον Jacob, αλλά τον ακούει, με τον Ben να τον πυροβολεί εξαιτίας αυτού του γεγονότος. Η έλλειψη εμπιστοσύνης των επιζώντων στο πρόσωπο του Jack ενισχύεται όταν αποκαλύπτεται πως η Juliet λειτουργούσε ως πληροφοριοδότρια, παρόλα αυτά η Juliet με τη σειρά της αποκαλύπτει ότι συνεργάζεται με τον Jack ενάντια στους Others. Μια σειρά από flashbacks δείχνουν την άφιξη του Ben στο νησί όταν ήταν ακόμα μικρό παιδί, ως μέλος της Dharma Initiative. Ο Ben συνωμοτεί με τους Others (ένας τουλάχιστον εκ των οποίων, ο Richard Alpert, δεν γερνάει ούτε μέρα για τα επόμενα τριάντα χρόνια), και σκοτώνει τα περισσότερα μέλη της Dharma.
Επεισόδιο 21: “Greatest Hits”
Ο Jack μαθαίνει για το σχέδιο των Others να στήσουν ενέδρα στους επιζώντες και να απαγάγουν τις έγγυες γυναίκες, και καταστρώνει ένα σχέδιο για να σκοτώσει τους Others με δυναμίτη. Για να μπορέσει ο Sayid να στείλει ένα σήμα κινδύνου από το δορυφορικό τηλέφωνο της Naomi, ο Charlie βουτά σε έναν υποθαλάσσιο σταθμό της Dharma που μπλοκάρει όλες τις τηλεπικοινωνίες. Ο Charlie καταγράφει τις πέντε σημαντικότερες στιγμές στη ζωή του.
Επεισόδιο 22: “Through the Looking Glass”
Σε αυτό το διπλής διάρκειας επεισόδιο, το σχέδιο του Jack να σκοτώσει τους Others στρέφεται εναντίον του, και ο Sayid μαζί με τον Jin και τον Bernard κρατούνται όμηροι από τους Others στην παραλία. Με αρχηγό τη Rousseau, οι ναυαγοί ταξιδεύουν στον πύργο τηλεπικοινωνιών για να απενεργοποιήσουν το σήμα κινδύνου της Rousseau. Η Naomi έρχεται σε επικοινωνία με το πλοίο της, αλλά μαχαιρώνεται από τον Locke, ο οποίος μαζί με τον Ben θεωρεί ότι οι επιζώντες κάνουν λάθος. Ο Charlie επικοινωνεί με την Penny Windmore στον υποθαλάσσιο σταθμό της Dharma, αλλά πνίγεται όταν ο σταθμός πλημμυρίζει εξαιτίας του Mikhail. Ο Sawyer, η Juliet και ο Hurley σώζουν τους ναυαγούς στην παραλία. Αντί για flashbacks, μια σειρά από flash forwards δείχνουν την αξιοθρήνητη ζωή του Jack μετά τη διάσωσή του από το νησί.